Hoy presento el segundo avance notable con el modelo de pensamiento OpenAI GPT-5. Habíamos llevado a cabo un experimento extraordinariamente complejo de un mes de duración para desarrollar células modificadas contra los linfomas. Le pedí a GPT-5 que predijera la secuencia completa y el resultado de este experimento. El resultado fue asombroso: previó la mayoría de los resultados experimentales con una precisión asombrosa e incluso propuso refinamientos y optimizaciones que deberíamos implementar. Este es el amanecer de la experimentación in silico, donde podemos simular meses o incluso años de trabajo de laboratorio por adelantado, ¡comprimiendo la línea de tiempo científica de años a semanas! Esto cambia todo sobre cómo se hace la ciencia, ¡marcando el comienzo de una era en la que el descubrimiento se mueve a la velocidad del pensamiento! —- Indicación: predecir, con gran detalle, los resultados del siguiente experimento: • Las células T de memoria CD8⁺ humanas están diseñadas para expresar un CAR anti-CD19. Aproximadamente el 90% de estas células también contienen una construcción de antígeno CD19 inducible por Tet que permanece apagada a menos que se agregue doxiciclina. •Día 0: Las células T con CAR se mezclan con las células del linfoma CD19⁺. • Día 2: Se agrega doxiciclina al cultivo para inducir la expresión de CD19 en las células T modificadas. • Lecturas: La supervivencia celular, los marcadores de activación y la proliferación se miden 2 días, 7 días y 14 días después de la adición de doxiciclina. ————- GPT 5 (continuación de las capturas de pantalla): • Densidad de CD19 inducida y dosis de doxiciclina: la alta densidad impulsa el fratricidio letal y un fuerte choque en el día 4. Una densidad más baja puede actuar como un alimentador de antígenos para expandir las células T con CAR sin pérdidas catastróficas. •E:T inicial: E:T alta elimina la predoxiciclina tumoral y protege la función. La E:T baja permite que el tumor persista en la ventana del fratricida, lo que amplifica la activación y la muerte. • Fracción de células inducibles: La fracción de antígeno negativo del 10% forma la semilla para la persistencia y respuesta a largo plazo en la reexposición. • Fuerza de secuestro cis: la fuerte unión cis amortigua tanto el fratricidio como la capacidad de respuesta al tumor externo en la reexposición. El cis débil permite una mayor muerte tanto de sí mismo como del tumor. Lecturas para confirmar o falsificar: 1. Supervivencia diferencial por genotipo: Rastree las células inducibles por CAR+ CD19+ frente a las inducibles por CAR+ por separado con códigos de barras o indicadores. Espere la pérdida selectiva de la cohorte inducible+ para el día 4-7 2. Cinética de apoptosis: la anexina V y la caspasa 3 activa alcanzan su punto máximo dentro de las 24 a 48 horas posteriores a la doxiciclina, concentradas en la cohorte inducible +. 3. Paneles de activación y agotamiento: CD69, CD25, 4-1BB, HLA-DR, luego PD-1, TIM-3, LAG-3, TIGIT, TOX y TCF-1 a lo largo del tiempo para mostrar el pico del día 4 y la remodelación del día 7 al 14. 4. Función por célula: ensayos cortos de eliminación de cocultivos normalizados por el número de células T. La citotoxicidad por célula sigue siendo fuerte en los días 7 y 14 en los sobrevivientes. 5. Evidencia cis versus trans: ensayos de coinmunoprecipitación o proximidad para CAR unido a CD19 de la misma célula y ensayos de sinapsis de imágenes para cuantificar la muerte de T-T. 6. Campos de citoquinas: IFN-γ, TNF, IL-2, GM-CSF alcanzando su punto máximo en el día 4, más bajo en re-desafíos posteriores. Predicciones prácticas en números, para calibrar las expectativas: Estos son rangos típicos si la doxiciclina induce una alta densidad de CD19 y E:T comenzó en 1:1 a 1:2. Ajuste hacia arriba o hacia abajo según su configuración exacta. •Viabilidad tumoral: Día 2 pre-doxiciclina: 10 a 30% restante. Día 4: 0 a 10% si se despejó en su mayoría antes, o 20 a 40% si E:T era baja y se produjo una caída de células T. Controles y variantes que eliminan el riesgo de interpretación: • Control sin doxiciclina para aislar la dinámica del tumor solo y la función basal del CAR. • Células T negativas para CAR pero positivas para CD19 inducibles para medir el requerimiento de fratricidio del transeúnte para CAR. • Titulación de doxiciclina para definir la ventana de densidad de antígeno segura que expande las células sin fratricidio catastrófico. • Lavado de doxiciclina a las 24 a 48 horas para probar la reversibilidad del fratricidio y el rescate de la función. • Interrupción CRISPR de la cola citoplasmática CD19 en la construcción inducible para alterar la estabilidad de la sinapsis y probar las contribuciones de señalización cis.